玉琮其功能与意义有：
一、祭祀用的大礼器之一，《周礼》“以苍璧礼天，以黄琮礼地”，玉琮成为统治阶级祭祀苍茫大地的礼器，也是巫师通神的法器。玉琮的造型是内圆（孔）外方，似是印证“璧圆象天，琮方象地”等道理。巫师也常用劣质的玉琮、石琮，或被烧过的玉琮，来镇墓压邪、敛尸防腐、避凶驱鬼。
二、玉琮也是权势和财富的象征。玉琮于墓葬中出土时有如下特征：墓葬规格高，规模大，随葬品较丰富；墓主人多为男性；琮常于壁伴出，一些墓中有殉葬人的现象。种种现象说明琮式与原始宗教及祭祀礼仪密切相关，它的主人必属部族酋长，大祭司巫师之上层人物， 从发掘现场可以看到，墓主身份越显赫，殉葬品中的琮、璧就越多，似乎要显示生前的一切，用于随葬恰好说明墓主原有身份，及其在各部落中享用财富与权势的程度，也代表良渚文化时期的一种葬制。